27 اردیبهشت 1403
امير عباس برزگري سرخه

امیر عباس برزگری سرخه

مرتبه علمی: استادیار
نشانی:
تحصیلات: دکترای تخصصی / زیست شناسی - فیزیولو‍ژی جانوری
تلفن:
دانشکده: دانشکده علوم پایه

مشخصات پژوهش

عنوان
بررسی بیوانفورماتیکی ترکیبات گیاه خوشاریز) Echinophora platyloba L. ( بهعنوان مهارکنندههای آنزیم بتالاکتاماز استافیلوکوکوس اورئوس
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
استافیلوکوکوس اورئوس، بتا لاکتاماز ، خوشاریزه، داکینگ مولکولی
سال 1402
پژوهشگران امیر عباس برزگری سرخه ، میلاد زارع ، سپیده پرویزپور

چکیده

استافیلوکوکوس اورئوس یک باکتری پاتوژن است که به دلیل مقاومت آن به آنتی بیوتیکها مشکلات زیادی را در سلامت ایجاد کرده است. یکی از علل مقاوم شدن این باکتری ترشح یک آنزیم خارج سلولی بنام بتالاکتاماز است که باعث غیر فعال شدن آنتی بیوتیک های بتالاکتام میشود. مطالعات پیشین نشان داده اند که گیاه خوشاریزه توانایی از بین بردن سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک این باکتری را داراست. بنابراین، هدف از مطالعه حاضر بررسی داکینگ مولکولی ترکیبات گیاه خوشاریزه با پروتئین بتالاکتاماز استافیلوکوکوس اورئوس برای یافتن ترکیبات مهاری احتمالی این آنزیم بود. برای انجام داکینگ مولکولی پس از آماده سازی لیگاندهای گیاه و آنزیم بتالاکتاماز از نرم افزار PyRx استفاده شد. سپس ترکیباتی از گیاه که بیشترین انرژی اتصال را داشتند انتخاب شدند. در مرحله بعد بررسی فارماکوکینتیک و سمیت دو ترکیب منتخب به ترتیب توسط پایگاه های داده آنلاین Swiss-ADME ، admetSAR 2.0 و II ProTox- انجام شد. نتایج نشان داد که دو ترکیب Spathulenol) و (beta-Caryophyllene oxide دارای بیشترین انرژی اتصال با جایگاه فعال بتالاکتاماز بودند. اگرچه دو ترکیب از نظر ویژگیهای فارماکوکینتک نسبتا مناسب بودند ترکیب Spathulenol در مطالعات بیشتر سمیت کلیوی و در موشهای بزرگ آزمایشگاهی سمیت حاد نشان داد. در نتیجه، تنها ترکیب beta-Caryophyllene oxide را میتوان به عنوان کاندیدای مهار کننده بتالاکتاماز معرفی کرد.