29 اردیبهشت 1403
محمد باقري

محمد باقری

مرتبه علمی: استاد
نشانی:
تحصیلات: دکترای تخصصی / حشره شناسی کشاورزی - کنه شناسی
تلفن:
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
روش های مختلف استخراج DNA از کنه های اریباتید
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
CTAB،کولینز، کیت، فنل- کلروفرم.DNPTM
سال 1395
پژوهشگران منصوره آهنی آزاد ، وحید رومی ، محمد باقری

چکیده

امروزه روش های مولکولی انقلاب عظیمی را در سیستماتیک حشرات و کنهها ایجاد کرده اند و به طور فزایندهای بر روی حشرات مورد استفاده قرار می گیرند. مارکرهای مولکولی در مقایسه با شاخصهای مورفومتریک از کارایی و ثبات بسیار بالایی برخوردار میباشند و موجب بهبود طبقه بندی فیلوژنتیکی می شوند. حال آنکه جثه کوچک کنهها امکان انجام چنین مطالعاتی را برای بیشتر گروه های کنه ها دشوار و گاه غیرممکن نموده و موجب نادیده گرفته شدن کنهها از لحاظ تکاملی شده است. با اینحال کوچکی جثه از یک سو و دارا بودن جلد سفت و سخت از سوی دیگر موجب دشواری کار با این گروه از کنهها (کنه های اریباتید) نسبت به سایر گروهها نظیر کنههای تترانیکیده، فیتوزئیده، اریوفیده،کنههای پارازیتوئید زنبور عسل، کنههای دامی گردیده است. لذا مطالعات بسیار محدودی در این زمینه صورت پذیرفته است. اهمیت زیاد کنه های اریباتید درکشاورزی، در دست نبودن اطلاعات کافی از وضعیت آرایه بندی و تبارشناسی این گروه از کنه ها و تضاد نظر موجود در رابطه با جایگاه برخی از تاکسونهای این زیرراسته موجب شده است که اخیرا توجهات زیادی در سراسر جهان جهت تعیین تنوع مورفولوژیک- مولکولی و تعیین روابط تبارشناسی این گروه از کنه ها صورت گیرد. تکنیک های مولکولی می توانند بعنوان مکمل مطالعات ریخت شناسی جهت برطرف نمودن ابهامات موجود مورد استفاده قرار گیرند. ترادف های DNAریبوزومی هسته ای از جمله ناحیه بین ژنی ITS2و ژنهای سیتوکروم اکسیداز I میتوکندریایی (COI) ابزارهای قدرتمندی را جهت مطالعات فیلوژنتیک در سطوح مختلف طبقه بندی فراهم می سازند. در بررسی حاضر کارایی چهار روشمختلف استخراجDNA از کنه های نگهداری شده در الکل 96 درصد مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظورDNAچهار گونه از کنههای اریباتید (Amerobelba sp.,Acrotritia sp1,Acrotritia sp2 andAmerus sp.) با استفاده از چهار روش شامل:(1) روشCTAB، (2) روش Colins، (3) روش فنل- کلروفرم و (4) کیت استخراجDNPTM (سیناژن) استخراج شد (یک عدد کنه در هر میکروتیوپ). DNAاستخراج شده در واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از دو جفت آغازگر برای تکثیر ناحیهCOI (C1-J-1751/C1-N-2191 و Arch1/HCO2198)و آغازگرهای ITS2Aو ITS2Bجهت تکثیر ناحیه ITS2مورد بررسی قرار گرفت.محصولاتPCRبا الکتروفورز روی ژل آگارز یک درصد مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج نشان داد ک