وحید رومی

ویروئیدها کوچکترین و ساده ترین بیمارگرهای گیاهی هستند که ژنوم آنها فقط از یک آر ان ای تک رشته ای، غیر کد کننده و حلقوی به طول 246 تا 401 نوکلئوتید تشکیل شده است. ویروئیدهای متعددی از دو خانواده Pospiviroidae و Avsunviroidae در سیب ایجاد بیماری می کنند و خسارت کمی و کیفی قابل توجهی به بار می آورند. به منظور مطالعه ویروئیدهای سیب در منطقه مراغه در طی بازدیدهایی در سال های 1395 و 1396 علائم لکه دار شدن و فرورفتگی میوه سیب بر روی رقم های گالا و رد دلیشیز از باغ های سیب جمع آوری و پس از استخراج آر آن ای کل با آزمون RT-PCR دو مرحله ای، وجود ویروئیدهای گزارش شده از سیب مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنوم کامل ویروئید فرورفتگی میوه سیب به طول 307-306 جفت باز تکثیر و ترادف 10 نمونه تعیین گردید. جستجوی ترادف ها با BLASTn و همردیف سازی آنها با ترادفهای مربوطه در بانک ژن نشان داد جدایه های مورد مطالعه دارای بیشترین و کمترین یکسانی ترادف را به میزان 100 و 74.4 درصد به ترتیب با رس-شمارهای EF088662 (ایتالیا) و KF788291 (ایتالیا) داشتند. بیشترین تفاوت ها در نوکلئوتیدها در بین نواحی CCRو TR قرار داشتند. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد جدایه های ایرانی به همراه جدایه ها و واریانت های گزارش شده از ایتالیا در یک گروه قرار می گیرند.