وحید رومی

در تابستان سالهای 1395 و 1396 تعداد 73 نمونه با علائم مشابه با ویروئید فرورفتگی میوه سیب از ارقام گالا و رد دلیشیز منطقهی مراغه جمعآوری شد. RNA کل از پوست ساقه و برگ نمونههای جمعآوری شده حاوی علایم لکههای فرورفته و خالهای زرد با حاشیه نامنظم روی پوست میوه، استخراج گردید و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، ژنوم کامل ویروئید به طول 307-306 جفت باز با آزمون RT-PCR تکثیر و ترادف 10 نمونه تعیین گردید. جستجوی ترادف ها با BLASTn و همردیفسازی آنها با ترادفهای مربوطه در بانک ژن نشان داد که جدایههای مورد مطالعه دارای بیشترین و کمترین یکسانی ترادف به میزان 100 و 4/74 درصد بترتیب با رس شمارهای EF088662 (ایتالیا) و KF788291 (ایتالیا) میباشند. بیشترین تفاوت نوکلئوتیدی در بین نواحی CCRو TR قرار داشتند. آنالیز فیلوژنتیک با روش حداکثر احتمال نشان داد که جدایه های ایرانی به همراه جدایهها و واریانتهای گزارش شده از ایتالیا در یک گروه قرار می گیرند.