ایندول-3-کاربینول یک ترکیب طبیعی موجود در در انواع سبزیجات چلیپائی است که اثرات ضد سرطانی آن در مطالعات بسیاری گزارش شده است. در این مطالعه، تاثیر ایندول-3-کاربینول بر بیان ژن در رده سلولی سرطان پستان MCF-7 برای شناسایی ژنهایی که در حساسیت به ایندول-3-کاربینول نقش مهمی دارند، بررسی شد. ابتدا دادههای ریزآرایه از GSE55897 برای یافتن ژنهای تغییر بیان یافته از پایگاه GEO در سلول MCF-7 تحت درمان ایندول-3-کاربینول استخراج و بررسی شدند. برهمکنش پروتئین-پروتئین با استفاده از پایگاه داده STRING و برنامه Cytoscape تجزیه و تحلیل شد. در مجموع 6748 ژن تغییر بیان یافته (|log2FC| ≥ 0 and adjusted P value ≤ 0.05) در مجموعه دادهی GSE55897 یافت شد. در سلولهای MCF-7 تیمار شده با ایندول-3-کاربینول، 2901 ژن افزایش بیان و 3847 ژن کاهش بیان نشان دادند. ژنهای EP300 و ESR1 بالاترین امتیاز را در شبکه پروتئین-پروتئین بر اساس رتبهبندی الگوریتم درجه در Cytoscape نشان دادند. ژنهای EP300 و ESR1 به عنوان ژنهای کلیدی انتخاب شدند. این مطالعه نشان داد که یکی از مکانیسمهای مولکولی ایندول-3-کاربینول در سلولهای سرطان پستان از نوع ESR-Positive، از طریق کاهش بیان ژن ESR1 است، بنابراین، ایندول-3-کاربینول میتواند به عنوان یک عامل ضدسرطانی امیدوارکننده در ترکیب با درمانهای مرسوم برای سرطان پستان از نوع ESR-Positive استفاده شود.