1405/01/28
زهره جهان افروز

زهره جهان افروز

مرتبه علمی: استادیار
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
شاخص H:
دانشکده: دانشکده علوم پایه
اسکولار:
پست الکترونیکی: jahanafrooz [at] maragheh.ac.ir
اسکاپوس:
تلفن: 04137278001-523
ریسرچ گیت:

مشخصات پژوهش

عنوان
بررسی بیوانفورماتیکی ژن‌های تغییر بیان یافته در اثر تیمار‌ با لوتئولین در رده سلولی سرطانی PC3
نوع پژوهش
مقاله چاپ‌شده در مجلات علمی
کلیدواژه‌ها
بیان ژن، چرخه سلولی، سرطان پروستات، لوتئولین، مقاومت دارویی
سال 1404
مجله زیست شناسی کاربردی
شناسه DOI
پژوهشگران زهره جهان افروز

چکیده

مقدمه: سرطان پروستات یکی از عوامل اصلی مرگ و میر در بین مردان جهان گزارش شده است. لوتئولین یک فلاونوئید گیاهی است که تاثیرات ضد سرطانی آن در مطالعات متعددی گزارش شده است.. هدف این مطالعه تعیین و بررسی ژن‌هایی است که در سلول سرطانی پروستات PC3 تحت تیمار با لوتئولین دچار تغییر بیان می‌شوند. روش‌ها: ابتدا داده‌های ریزآرایه مربوط به GSE53181 برای یافتن ژن‌های تغییر بیان یافته از پایگاه GEO استخراج و بررسی شدند. مسیرهای سیگنالینگ ژن‌های تغییر بیان یافته با وبگاه Enrichr و نرم افزار R بررسی شد. برهمکنش پروتئین-پروتئین با استفاده از پایگاه STRING و برنامه Cytoscape برای تعیین ژن‌های hub بررسی شد. ارتباط ژن‌های hub با مقاومت به داروی دوستاکسل از پایگاه داده RNAactDrug مورد بررسی قرار گرفت. نتایج و بحث: بر طبق روش GEO2R و نرم‌افزار R، لوتئولین باعث افزایش بیان 3353 ژن و کاهش بیان 5522 ژن به طور معنی‌دار شده است. چرخه سلولی و همانند سازی DNA معنی‌دارترین مسیر‌های سلولی تغییر یافته بودند. اکثر ژن‌های تغییر بیان یافته‌ی مربوط به چرخه سلولی دچار کاهش بیان شده بودند. 10 ژن به عنوان ژن hub یافت شد که در میان آن‌ها بر اساس رتبه‌بندی الگوریتم Degree، ژن‌ CDK1 بالاترین درجه را در شبکه پروتئین-پروتئین نشان داد. بر طبق RNAactDrug، لوتئولین با کاهش بیان ژن‌های CDK1، TOP2A و CCNB1 می‌تواند باعث افزایش حساسیت دارویی به داروی دوستاکسل شود. این مطالعه نشان دهنده این است که لوتئولین می‌تواند به عنوان یک ضد سرطان امیدبخش برای سرطان پروستات در ترکیب با داروهای شیمی درمانی مورد استفاده قرار گیرد.