در آخرین رتبه‌بندی منتشره از سوی موسسه استنادی و پایش علم و فناوری جهان اسلام (ISC) مربوط به سال 1401-1400، دانشگاه مراغه با کسب رتبه 40، رتبه خود را با 12 پله افزایش نسبت به سال 1400-1399، بهبود داد.
رتبه‌بندی ISC براساس شاخص‌ها و معیارهای تخصصی در حوزه علم‌سنجی و متناسب با سیاست‌های کلان علم و فناوری ابلاغی از سوی مقام معظم رهبری صورت می‌پذیرد و محاسبات امتیاز دانشگاه‌ها در شاخص‌ها و زیرشاخص‌ها همگی براساس داده‌های خام هر دانشگاه، مستندات ارائه شده توسط دانشگاه و روابط مشخص آماری انجام می شود.