| عنوان
|
پراکندگی و تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس آ انگور (GVA )در
تاکستان های مراغه و ارومیه
|
| نوع پژوهش
|
پایان نامه
|
| کلیدواژه‌ها
|
مو ویروس ای مو
|
| چکیده
|
انگور در برابر طیف وسیعی از عوامل بیماری زای گیاهی از جمله ویروس ها حساس می باشد. تاکنون بیش از 60 ویروس مختلف از تاکستان های سراسر دنیا شناسائی شده اند. تحقیق حاضر با هدف تعیین پراکندگی و تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس آ انگور (GVA) در تاکستان های مراغه و ارومیه با استفاده از روش های الایزای مستقیم(DAS-ELISA) و RT-PCR صورت گرفت. پس از بررسی های آزمایشگاهی از مجموع 425 نمونه جمع آوری شده از مناطق مختلف شهرستان های ارومیه و شهرستان مراغه از پنج رقم مورد بررسی (کشمشی بیدانه، انگور سیاه، فخری، گرمیان مراغه و قزل اوزوم) در مجموع برای GVA و GFLV بترتیب 52 و 143 مورد آلودگی یافت شد که در این بین رقم کشمشی بیدانه با توجه به وسعت کشت بیشترین درصد آلودگی بترتیب 88/16 و 36 درصد را نشان داد، سپس رقم قزل اوزوم با 6/16 ، 25 درصد، رقم گرمیان مراغه با 16٪، - رقم انگور سیاه با 8/9، 33/33 درصد و در آخر رقم فخری با 2/9، 4/29 درصد رتبه های بعدی آلودگی را به خود اختصاص دادند. در ارزیابی کلی، میزان آلودگی در هر دو شهرستان، ارومیه نزدیک 13 و 26 درصد و در مراغه 14 و 6/41 درصد بود. RNA کل از پوست ساقه نمونه های آلوده با استفاده از سه روش: استفاده از محلول RNXTM(-Plus) ،کیت RNeasy Plant Mini kit و کیت Total RNAPurification Kit استخراج شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروس آ انگور به منظور تکثیر بخشی از ORF5 انجام گرفت. قطعات مورد انتظار در آزمون PCR تکثیر شد و 8 جدایه تعیین ترادف گردید. ترادف های بدست آمده با استفاده از موتور جستجوی بلاست با ترادف های موجود در بانک ژن مقایسه گردید و میزان یکسانی ترادف 95-83 درصد بود. همردیف سازی ترادف ها و ترسیم درخت فیلوژنتیک نشان داد جدایه های آذربایجان شرقی و غربی به همراه دیگر جدایه های ایران در یک گروه قرار می گیرند.
|
| پژوهشگران
|
وحیدرومی (استاد راهنما)، میناراستگو (استاد راهنما)، مریممیکائیلی (دانشجو)
|