| عنوان
|
بررسی بیوانفورماتیکی آنزیم گلوکزاکسیداز نوترکیب بیان شده در مخمر یارروویا لیپولیتیکا و بهینه سازی تولید آن با روش طراحی آزمایش تاگوچی
|
| عنوان مجله
|
دنیای میکروب ها
|
| نوع پژوهش
|
مقاله چاپ شده
|
| کلیدواژه‌ها
|
یارروویا لیپولیتیکا، گلوکزاکسیداز، بیوانفورماتیک، تاگوچی.
|
| چکیده
|
سابقه و هدف: آنزیم گلوکزاکسیداز کاربرد فراوانی در صنایع پزشکی، دارویی، غذایی، نساجی و محیطی دارد. بیان هترولوگ این آنزیم در میزبان های مخمری به دلیل برخی از محدودیت های تولید صنعتی این آنزیم توسط آسپرژیلوس نایجر بررسی شده است. این مطالعه با هدف بررسی خصوصیات بیوانفورماتیکی گلوکزاکسیداز در سویه نوترکیب مخمر یارروویا لیپولیتیکا Po1g-GOX و بهینه سازی شرایط تولید این آنزیم به روش تاگوچی صورت گرفت.
مواد و روش ها: توالی پروتئین، ساختارهای اول، دوم، سوم و میزان گلیکوزیلاسیون آنزیم نوترکیب گلوکزاکسیداز با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی بررسی شد. بهینه سازی تولید آنزیم نوترکیب برای گلوکز، پپتون، عصاره مخمر و pH در محیط YPD دارای تیامین در 4 سطح ببرای نرم افزار Qualitek-4 تعریف شد. میزان تولید آنزیم سنجش و با نرم افزار تجزیه و تحلیل شد.
یافته ها: گلوکزاکسیداز نوترکیب دارای 605 اسیدآمینه بوده که ساختار دوم آن دارای 29 درصد مارپیچ آلفا، 16 درصد صفحه بتا و 54 درصد کویل است که با ساختار دوم توالی اسیدآمینه گلوکزاکسیداز طبیعی آسپرژیلوس نایجر تشابه زیادی را نشان داد. 8 جایگاه گلیکوزیلاسیون در این پروتئین نوترکیب قرار دارد و ساختار سوم دارای یک دومین بوده و تشابه بالایی با گلوکزاکسیداز طبیعی دارد. بیشترین تولید آنزیم گلوکزاکسیداز نوترکیب در شرایط بهینه در محیط کشت حاوی 30 گرم در لیتر گلوکز، 5 گرم در لیتر عصاره مخمر، 15 گرم در لیتر پپتون و pH حدود 7 بدست آمد.
نتیجه گیری: گلوکز اکسیداز نوترکیب یارروویا بدلیل شباهت بالا با گلوکزاکسیداز طبیعی پتانسیل مناسبی جهت کاربرد در صنایع دارویی و غذایی دارد.
|
| پژوهشگران
|
فاطمهخدیوی درخشان (نفر اول)، فرشاددرویشی هرزویلی (نفر دوم)، مهروزدزفولیان (نفر سوم)، کاترینمادزاک (نفر چهارم)
|